imagej 怎么用魔棒选中伤口

发布网友 发布时间：2022-03-28 15:15

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热心网友 时间：2022-03-28 16:44

具体步骤：

打开imageJ软件;

2.将单张/多张图片文件拖至软件区域内快速打开<Drag and drop>,选中自己准备处理的图片;

3.调整图片角度Image ==> Transtate ==> Rotate; 正值为顺时针旋转,负值为逆时针旋转

4.图片达到符合要求的角度; 以标尺水平为标准来衡量

5、调整标尺与伤口之间的距离：剪切部分标尺图片（选择矩形选框，选定，ctrl+x剪切），粘贴（ctrl+v粘贴），移动到适当的位置；

6、框选面积合适的区域，裁剪选定区域之外的图片 Image==> Crop，用ctrl+PgUp/PgDn调节图片比例与大小；

此处默认保留标尺长度为2-2.5CM，标尺上缘距离伤口约0.5CM，伤口居中，图片约呈正方形

7、调整图片亮度与对比度Image==> Brightness/Contrast；

个人习惯先调整亮度，再调整对比度，最后点击Apply

8、调整颜色阈值，通过改变阈值选定伤口区域：Image==> Adjust ==> Color Threshold；点击菜单栏“魔棒键”，点击选中区域，自动生成ROI；

** 调节标准：尽可能精准地覆盖全部伤口区域，如果伤口内部有少量区域未选到，或者伤口外部选到了部分区域，但未与伤口边缘相连接，则不要紧，关键是精准勾画出伤口边缘；另外，如果有少量区域覆盖不到，可以考虑在别的地方稍加扩张，以补偿缺失面积（是否可以这么做有待商榷）；

共三个调节指标：色相、饱和度、亮度。上一排是“选择区域”，下一排是“去除区域”

调整色相，调整饱和度，调整亮度

用魔法棒点击色块区域，自动勾画出色块边缘；可通过ROI管理器中的 original VS filtered 键对比色块和原图重叠程度

9、选择菜单栏第4个图标freehand sections，通过自己的勾画选择伤口区域；将勾选区域存入ROI管理器中Analyze==> Tools ==> ROI Manager ==> Add；

点击Add存入勾选区，点击Rename重命名

10、设置标准距离：选择菜单栏第5个图标直线工具Wand tool，在已知长度的标尺上勾画一段距离，再设置标准距离Analyze ==> Set Scale;

Known distance中填上勾画距离的长度，Unit上规定单位

11、同样步骤处理其余图片，将所有图片的ROI都存入管理器，并且定好每张图片的标准距离；

ROI管理器中显示所有ROI

12、计算ROI面积并保存数据：选中某张图片，再选中ROI管理器中相应ROI，点击Measure进行测量；直至所有图片相应的ROI全部测完，保存测量数据为csv文件；

一定要注意每张图片（标准距离）与每个ROI的对应性，不可在选定一张图片的同时选择全部ROI计算，否则均按该图片的标准距离计算面积

记得保存数据，后续再做统计分析

13、保存ROI：选中所有/某几个/某个ROI，在ROI管理器界面选择More ==> Save，保存ROI。

保留ROI可以避免后续要再重画ROI

14、保存处理后的图片：选中某张图片，还原颜色阈值对图片颜色的改变（会被保存）：Image==> Adjust ==> Color Threshold ==> Original；去除所有选框，将图片分辨率调整至600dpi: Image ==> Adjust==> Scale to DPI；必要时可打开图片信息确认无误Image==> Show Info；保存图片File ==> Save。

默认调整为600dpi，不需改变

注意信息里的 600 pixels per inch (ppi)

默认保存为TIFF格式

15、确认统计数据与图片无误，关闭各个窗口，关闭软件，操作结束。

热心网友 时间：2022-03-28 18:02